PPIEs: Protein-Protein Interaction Information Extraction system
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http://hdl.handle.net/10045/5046
Title: | PPIEs: Protein-Protein Interaction Information Extraction system |
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Other Titles: | PPIEs: sistema de extracción de información sobre interacciones entre proteínas |
Authors: | Danger Mercaderes, Roxana | Rosso, Paolo | Pla Santamaría, Ferrán | Molina Marco, Antonio |
Keywords: | Extracción de información | Interacción entre proteínas | Information extraction | Protein-protein interaction |
Issue Date: | Apr-2008 |
Publisher: | Sociedad Española para el Procesamiento del Lenguaje Natural |
Citation: | DANGER MERCADERES, Roxana, et al. "PPIEs: Protein-Protein Interaction Information Extraction system". Procesamiento del lenguaje natural. N. 40 (abr. 2008). ISSN 1135-5948, pp. 137-143 |
Abstract: | En la literatura aparecen más de tres millones de artículos acerca de las proteínas y sus interacciones (PPI). En este trabajo se expone una arquitectura plausible y algunos experimentos preliminares de nuestro sistema de extracción de información sobre interacciones entre proteínas, PPIEs. Los resultados obtenidos son muy prometedores, por lo que el trabajo merece ulteriores desarrollos. Este estudio ha permitido, además, identificar algunos aspectos a mejorar en el futuro: el reconocimiento de entidades y el almacenaje y búsqueda de datos léxicos (en particular, los vocabularios controlados) y el descubrimiento de conocimiento para el enriquecimiento de ontologías. | More than three millions research articles have been written about proteins and Protein-Protein Interactions (PPI). The present work describes a plausible architecture and some preliminary experiments of our Protein-Protein Interaction Information Extraction system, PPIEs. The promising results obtained suggest that the approach deserves further efforts. Some important aspects that need to be improved in the future have been identified: entity recognition; lexical data storage and searching (in particular, controlled vocabularies); knowledge discovery for ontology enrichment. |
Sponsor: | This work has been funded by the projects TIN2006-15265-C06-04 and “Juan de la Cierva” of the Ministry of Education and Science of Spain. |
URI: | http://hdl.handle.net/10045/5046 |
ISSN: | 1135-5948 |
Language: | eng |
Type: | info:eu-repo/semantics/article |
Appears in Collections: | Procesamiento del Lenguaje Natural - Nº 40 (abril 2008) |
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