Biomedical event extraction using Kybots

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Title: Biomedical event extraction using Kybots
Other Titles: Extracción de eventos biomédicos usando Kybots
Authors: Casillas Rubio, Arantza | Díaz de Ilarraza Sánchez, Arantza | Gojenola Galletebeitia, Koldo | Oronoz Anchordoqui, Maite | Rigau Claramunt, German
Keywords: Extracción de información | Biomedicina | PLN | Information extraction | Biomedicine | NLP
Knowledge Area: Lenguajes y Sistemas Informáticos
Issue Date: Sep-2011
Publisher: Sociedad Española para el Procesamiento del Lenguaje Natural
Citation: CASILLAS, Arantza, et al. “Biomedical event extraction using Kybots”. Procesamiento del Lenguaje Natural. N. 47 (2011). ISSN 1135-5948, pp. 31-38
Abstract: Este artículo presenta la aplicación de un sistema general de Extracción de Información desarrollado para extraer conocimiento conceptual y factual de textos al dominio específico de la biomedicina. El sistema, previamente desarrollado durante el proyecto KYOTO, está basado en reglas, y es usado para la extracción de eventos biomédicos que implican proteínas y genes en textos anotados pertenecientes al BioNLP11 Shared Task. | This paper shows the applicability of a general Information Extraction technology developed for the extraction of conceptual and factual knowledge from texts, to the specific domain of biomedicine. The rule-based system previously developed for the KYOTO Project is used to extract biomedical events involving proteins or genes from texts annotated in the BioNLP11 Shared Task.
Sponsor: This work has been supported by the Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación (KNOW2 TIN2009-14715-C04-01), the European Comission (KYOTO ICT-2007-211423) and the Basque Government (IT344-10).
URI: http://hdl.handle.net/10045/18510
ISSN: 1135-5948
Language: eng
Type: info:eu-repo/semantics/article
Peer Review: si
Appears in Collections:Revistas - Procesamiento del Lenguaje Natural - Nº 47 (2011)

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